Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL25A1Q9BXS0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL25A1Q9BXS0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL25A1Q9BXS0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms