Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GINS3Q9BRX5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GINS3Q9BRX5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms