Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF558Q96NG5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF558Q96NG5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF558Q96NG5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms