Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPNS2Q96L46 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPNS2Q96L46 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPNS2Q96L46 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
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