Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HHIPL1Q96JK4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HHIPL1Q96JK4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HHIPL1Q96JK4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HHIPL1Q96JK4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HHIPL1Q96JK4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HHIPL1Q96JK4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HHIPL1Q96JK4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HHIPL1Q96JK4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HHIPL1Q96JK4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HHIPL1Q96JK4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HHIPL1Q96JK4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HHIPL1Q96JK4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HHIPL1Q96JK4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms