Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SIRT1Q96EB6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SIRT1Q96EB6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SIRT1Q96EB6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
SIRT1Q96EB6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
SIRT1Q96EB6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SIRT1Q96EB6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SIRT1Q96EB6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SIRT1Q96EB6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SIRT1Q96EB6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SIRT1Q96EB6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SIRT1Q96EB6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SIRT1Q96EB6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SIRT1Q96EB6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SIRT1Q96EB6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SIRT1Q96EB6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SIRT1Q96EB6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SIRT1Q96EB6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SIRT1Q96EB6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms