Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKL1Q969V6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKL1Q969V6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MKL1Q969V6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms