Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX1Q92499 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX1Q92499 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX1Q92499 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms