Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CASKIN1Q8WXD9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CASKIN1Q8WXD9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CASKIN1Q8WXD9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CASKIN1Q8WXD9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CASKIN1Q8WXD9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CASKIN1Q8WXD9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CASKIN1Q8WXD9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CASKIN1Q8WXD9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CASKIN1Q8WXD9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CASKIN1Q8WXD9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CASKIN1Q8WXD9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CASKIN1Q8WXD9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CASKIN1Q8WXD9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CASKIN1Q8WXD9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CASKIN1Q8WXD9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CASKIN1Q8WXD9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
CASKIN1Q8WXD9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms