Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFP28Q8NHY6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZFP28Q8NHY6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZFP28Q8NHY6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms