Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG8Q8ND04 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG8Q8ND04 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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