Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC82Q8N4S0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC82Q8N4S0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC82Q8N4S0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms