Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPAS3Q8IXF0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPAS3Q8IXF0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms