Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IFNL1Q8IU54 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFNL1Q8IU54 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFNL1Q8IU54 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms