Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMIGD1Q6UXZ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMIGD1Q6UXZ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMIGD1Q6UXZ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMIGD1Q6UXZ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMIGD1Q6UXZ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMIGD1Q6UXZ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMIGD1Q6UXZ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMIGD1Q6UXZ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms