Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LETMD1Q6P1Q0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LETMD1Q6P1Q0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETMD1Q6P1Q0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms