Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PAPPA-AS1Q5QFB9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms