Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFAIP8L3Q5GJ75 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms