Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFT2D3Q587I9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFT2D3Q587I9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms