Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIF1AQ16665 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIF1AQ16665 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HIF1AQ16665 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
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