Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC18A3Q16572 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC18A3Q16572 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC18A3Q16572 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms