Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCOLCEQ15113 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCOLCEQ15113 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms