Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
EEA1Q15075 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
EEA1Q15075 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
EEA1Q15075 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
EEA1Q15075 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
EEA1Q15075 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
EEA1Q15075 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC38.27■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
EEA1Q15075 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
EEA1Q15075 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
EEA1Q15075 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
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