Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDC1Q14676 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MDC1Q14676 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MDC1Q14676 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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