Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms