Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CALCOCO2Q13137 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CALCOCO2Q13137 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms