Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACACAQ13085 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACACAQ13085 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACACAQ13085 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms