Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFAMQ00059 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFAMQ00059 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms