Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX1P67809 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX1P67809 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX1P67809 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX1P67809 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX1P67809 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX1P67809 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX1P67809 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX1P67809 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YBX1P67809 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX1P67809 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX1P67809 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX1P67809 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX1P67809 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX1P67809 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX1P67809 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX1P67809 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YBX1P67809 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YBX1P67809 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YBX1P67809 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YBX1P67809 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YBX1P67809 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YBX1P67809 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YBX1P67809 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YBX1P67809 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YBX1P67809 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
YBX1P67809 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
YBX1P67809 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YBX1P67809 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YBX1P67809 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YBX1P67809 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YBX1P67809 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YBX1P67809 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YBX1P67809 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YBX1P67809 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YBX1P67809 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YBX1P67809 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YBX1P67809 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YBX1P67809 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YBX1P67809 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YBX1P67809 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YBX1P67809 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YBX1P67809 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YBX1P67809 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YBX1P67809 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YBX1P67809 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YBX1P67809 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YBX1P67809 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YBX1P67809 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YBX1P67809 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YBX1P67809 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YBX1P67809 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YBX1P67809 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YBX1P67809 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YBX1P67809 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YBX1P67809 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YBX1P67809 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YBX1P67809 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YBX1P67809 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YBX1P67809 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YBX1P67809 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YBX1P67809 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YBX1P67809 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YBX1P67809 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YBX1P67809 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YBX1P67809 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YBX1P67809 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YBX1P67809 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YBX1P67809 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
YBX1P67809 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YBX1P67809 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YBX1P67809 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YBX1P67809 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YBX1P67809 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YBX1P67809 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YBX1P67809 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YBX1P67809 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YBX1P67809 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YBX1P67809 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YBX1P67809 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YBX1P67809 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YBX1P67809 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YBX1P67809 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YBX1P67809 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YBX1P67809 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YBX1P67809 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YBX1P67809 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YBX1P67809 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YBX1P67809 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YBX1P67809 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YBX1P67809 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YBX1P67809 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YBX1P67809 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YBX1P67809 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YBX1P67809 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YBX1P67809 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YBX1P67809 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YBX1P67809 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YBX1P67809 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YBX1P67809 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms