Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P62891 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P62891 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P62891 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P62891 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P62891 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P62891 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P62891 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P62891 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P62891 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P62891 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P62891 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P62891 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P62891 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P62891 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPL39P62891 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P62891 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P62891 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P62891 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P62891 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P62891 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P62891 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P62891 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P62891 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P62891 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPL39P62891 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPL39P62891 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P62891 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P62891 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P62891 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P62891 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P62891 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P62891 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P62891 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P62891 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P62891 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P62891 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P62891 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P62891 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P62891 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P62891 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P62891 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P62891 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P62891 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P62891 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P62891 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P62891 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P62891 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P62891 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P62891 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P62891 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P62891 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P62891 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P62891 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P62891 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P62891 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P62891 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P62891 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P62891 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P62891 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P62891 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P62891 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P62891 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P62891 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P62891 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P62891 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P62891 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P62891 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P62891 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P62891 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P62891 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P62891 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P62891 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P62891 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P62891 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P62891 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P62891 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P62891 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P62891 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P62891 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P62891 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P62891 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P62891 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RPL39P62891 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.9 ms