Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP107P57740 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP107P57740 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP107P57740 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP107P57740 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP107P57740 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP107P57740 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP107P57740 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP107P57740 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP107P57740 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP107P57740 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP107P57740 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP107P57740 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP107P57740 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP107P57740 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP107P57740 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP107P57740 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP107P57740 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP107P57740 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP107P57740 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP107P57740 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NUP107P57740 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
NUP107P57740 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP107P57740 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP107P57740 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP107P57740 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP107P57740 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP107P57740 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP107P57740 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP107P57740 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP107P57740 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP107P57740 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP107P57740 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP107P57740 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP107P57740 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP107P57740 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP107P57740 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP107P57740 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP107P57740 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP107P57740 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP107P57740 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP107P57740 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP107P57740 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP107P57740 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP107P57740 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP107P57740 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP107P57740 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP107P57740 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP107P57740 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP107P57740 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP107P57740 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP107P57740 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP107P57740 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP107P57740 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP107P57740 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP107P57740 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP107P57740 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP107P57740 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP107P57740 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP107P57740 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP107P57740 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP107P57740 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP107P57740 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP107P57740 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP107P57740 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP107P57740 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP107P57740 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP107P57740 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP107P57740 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP107P57740 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP107P57740 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP107P57740 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP107P57740 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP107P57740 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP107P57740 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP107P57740 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP107P57740 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP107P57740 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP107P57740 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP107P57740 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP107P57740 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP107P57740 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP107P57740 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms