Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMB2P55268 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMB2P55268 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMB2P55268 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMB2P55268 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMB2P55268 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMB2P55268 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LAMB2P55268 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LAMB2P55268 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMB2P55268 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMB2P55268 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMB2P55268 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMB2P55268 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMB2P55268 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms