Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC18A1P54219 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A1P54219 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms