Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CLTCL1P53675 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
CLTCL1P53675 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLTCL1P53675 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLTCL1P53675 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.77■■■■□ 3
CLTCL1P53675 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CLTCL1P53675 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CLTCL1P53675 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CLTCL1P53675 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CLTCL1P53675 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLTCL1P53675 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLTCL1P53675 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLTCL1P53675 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms