Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TM4SF4P48230 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TM4SF4P48230 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms