Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 GEP3YOR205C 1671 nt4.93□□□□□ -1.62
DDI1P40087 TPS3YMR261C 3165 nt4.93□□□□□ -1.62
DDI1P40087 SRG1SRG1 551 nt4.93□□□□□ -1.62
DDI1P40087 SNF11YDR073W 510 nt4.93□□□□□ -1.62
DDI1P40087 GTO1YGR154C 1071 nt4.93□□□□□ -1.62
DDI1P40087 CBT1YKL208W 816 nt4.93□□□□□ -1.62
DDI1P40087 snR10snR10 245 nt4.93□□□□□ -1.62
DDI1P40087 ISU2YOR226C 471 nt4.93□□□□□ -1.62
DDI1P40087 RDL1YOR285W 420 nt4.93□□□□□ -1.62
DDI1P40087 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.93□□□□□ -1.62
DDI1P40087 TDA7YNL176C 1911 nt4.93□□□□□ -1.62
DDI1P40087 MCH4YOL119C 1506 nt4.92□□□□□ -1.62
DDI1P40087 SHE10YGL228W 1734 nt4.92□□□□□ -1.62
DDI1P40087 CLF1YLR117C 2064 nt4.92□□□□□ -1.62
DDI1P40087 CAX4YGR036C 720 nt4.92□□□□□ -1.62
DDI1P40087 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt4.92□□□□□ -1.62
DDI1P40087 NPT1YOR209C 1290 nt4.92□□□□□ -1.62
DDI1P40087 SIF2YBR103W 1608 nt4.92□□□□□ -1.62
DDI1P40087 ATG18YFR021W 1503 nt4.92□□□□□ -1.62
DDI1P40087 GPR1YDL035C 2886 nt4.91□□□□□ -1.62
DDI1P40087 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt4.91□□□□□ -1.62
DDI1P40087 ADK2YER170W 678 nt4.91□□□□□ -1.62
DDI1P40087 ZRT1YGL255W 1131 nt4.91□□□□□ -1.62
DDI1P40087 YHR145CYHR145C 357 nt4.91□□□□□ -1.62
DDI1P40087 YKL107WYKL107W 930 nt4.91□□□□□ -1.62
DDI1P40087 MRK1YDL079C 1506 nt4.91□□□□□ -1.62
DDI1P40087 CAF4YKR036C 1932 nt4.9□□□□□ -1.62
DDI1P40087 SHM1YBR263W 1473 nt4.9□□□□□ -1.62
DDI1P40087 PDE1YGL248W 1110 nt4.9□□□□□ -1.63
DDI1P40087 STE7YDL159W 1548 nt4.9□□□□□ -1.63
DDI1P40087 CUE2YKL090W 1332 nt4.9□□□□□ -1.63
DDI1P40087 ULA1YPL003W 1389 nt4.9□□□□□ -1.63
DDI1P40087 APM4YOL062C 1476 nt4.89□□□□□ -1.63
DDI1P40087 LUC7YDL087C 786 nt4.89□□□□□ -1.63
DDI1P40087 ARB1YER036C 1833 nt4.88□□□□□ -1.63
DDI1P40087 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt4.88□□□□□ -1.63
DDI1P40087 PAN6YIL145C 930 nt4.88□□□□□ -1.63
DDI1P40087 MOG1YJR074W 657 nt4.88□□□□□ -1.63
DDI1P40087 YAR061WYAR061W 204 nt4.88□□□□□ -1.63
DDI1P40087 PIN2YOR104W 849 nt4.88□□□□□ -1.63
DDI1P40087 URA7YBL039C 1740 nt4.88□□□□□ -1.63
DDI1P40087 NOT3YIL038C 2511 nt4.88□□□□□ -1.63
DDI1P40087 DFG5YMR238W 1377 nt4.88□□□□□ -1.63
DDI1P40087 YLH47YPR125W 1365 nt4.88□□□□□ -1.63
DDI1P40087 GDB1YPR184W 4611 nt4.88□□□□□ -1.63
DDI1P40087 UGA1YGR019W 1416 nt4.88□□□□□ -1.63
DDI1P40087 RPT1YKL145W 1404 nt4.88□□□□□ -1.63
DDI1P40087 ADE13YLR359W 1449 nt4.88□□□□□ -1.63
DDI1P40087 TUP1YCR084C 2142 nt4.87□□□□□ -1.63
DDI1P40087 YFL034WYFL034W 3222 nt4.87□□□□□ -1.63
DDI1P40087 NUP1YOR098C 3231 nt4.87□□□□□ -1.63
DDI1P40087 MHF2YDL160C-A 243 nt4.87□□□□□ -1.63
DDI1P40087 IPK1YDR315C 846 nt4.87□□□□□ -1.63
DDI1P40087 WTM2YOR229W 1404 nt4.87□□□□□ -1.63
DDI1P40087 MNS1YJR131W 1650 nt4.86□□□□□ -1.63
DDI1P40087 MMP1YLL061W 1752 nt4.86□□□□□ -1.63
DDI1P40087 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt4.86□□□□□ -1.63
DDI1P40087 NPY1YGL067W 1155 nt4.86□□□□□ -1.63
DDI1P40087 SCW4YGR279C 1161 nt4.86□□□□□ -1.63
DDI1P40087 PRP45YAL032C 1140 nt4.86□□□□□ -1.63
DDI1P40087 ENV7YPL236C 1095 nt4.86□□□□□ -1.63
DDI1P40087 PCA1YBR295W 3651 nt4.86□□□□□ -1.63
DDI1P40087 HXT14YNL318C 1623 nt4.86□□□□□ -1.63
DDI1P40087 YHR045WYHR045W 1683 nt4.86□□□□□ -1.63
DDI1P40087 GUS1YGL245W 2127 nt4.85□□□□□ -1.63
DDI1P40087 ERD1YDR414C 1089 nt4.85□□□□□ -1.63
DDI1P40087 CTR2YHR175W 570 nt4.85□□□□□ -1.63
DDI1P40087 VMA13YPR036W 1437 nt4.85□□□□□ -1.63
DDI1P40087 NUD1YOR373W 2556 nt4.84□□□□□ -1.63
DDI1P40087 YIL067CYIL067C 2037 nt4.84□□□□□ -1.63
DDI1P40087 RPL12AYEL054C 498 nt4.84□□□□□ -1.63
DDI1P40087 BNS1YGR230W 414 nt4.84□□□□□ -1.63
DDI1P40087 ROX3YBL093C 663 nt4.84□□□□□ -1.63
DDI1P40087 ECM2YBR065C 1095 nt4.84□□□□□ -1.63
DDI1P40087 CPS1YJL172W 1731 nt4.83□□□□□ -1.64
DDI1P40087 FHL1YPR104C 2811 nt4.83□□□□□ -1.64
DDI1P40087 CDC21YOR074C 915 nt4.83□□□□□ -1.64
DDI1P40087 VHC1YBR235W 3363 nt4.82□□□□□ -1.64
DDI1P40087 SEC9YGR009C 1956 nt4.82□□□□□ -1.64
DDI1P40087 TFC7YOR110W 1308 nt4.82□□□□□ -1.64
DDI1P40087 PEX7YDR142C 1128 nt4.82□□□□□ -1.64
DDI1P40087 YDR154CYDR154C 351 nt4.82□□□□□ -1.64
DDI1P40087 RPL28YGL103W 450 nt4.82□□□□□ -1.64
DDI1P40087 ZRT2YLR130C 1269 nt4.82□□□□□ -1.64
DDI1P40087 SWP1YMR149W 861 nt4.82□□□□□ -1.64
DDI1P40087 SEG2YKL105C 3399 nt4.81□□□□□ -1.64
DDI1P40087 COX26YDR119W-A 201 nt4.81□□□□□ -1.64
DDI1P40087 DFM1YDR411C 1026 nt4.81□□□□□ -1.64
DDI1P40087 KRE9YJL174W 831 nt4.81□□□□□ -1.64
DDI1P40087 YLL059CYLL059C 507 nt4.81□□□□□ -1.64
DDI1P40087 MRPL36YBR122C 534 nt4.81□□□□□ -1.64
DDI1P40087 NUP116YMR047C 3342 nt4.8□□□□□ -1.64
DDI1P40087 ATG20YDL113C 1923 nt4.8□□□□□ -1.64
DDI1P40087 ARN2YHL047C 1863 nt4.8□□□□□ -1.64
DDI1P40087 RPS16BYDL083C 432 nt4.8□□□□□ -1.64
DDI1P40087 UTR4YEL038W 684 nt4.8□□□□□ -1.64
DDI1P40087 YHR095WYHR095W 495 nt4.8□□□□□ -1.64
DDI1P40087 YOR200WYOR200W 399 nt4.8□□□□□ -1.64
DDI1P40087 HAL1YPR005C 885 nt4.8□□□□□ -1.64
DDI1P40087 PZF1YPR186C 1290 nt4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms