Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHKAP35790 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHKAP35790 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHKAP35790 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHKAP35790 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHKAP35790 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHKAP35790 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHKAP35790 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHKAP35790 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHKAP35790 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHKAP35790 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHKAP35790 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHKAP35790 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHKAP35790 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHKAP35790 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKAP35790 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKAP35790 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKAP35790 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKAP35790 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKAP35790 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKAP35790 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKAP35790 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKAP35790 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKAP35790 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKAP35790 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKAP35790 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHKAP35790 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHKAP35790 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHKAP35790 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHKAP35790 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHKAP35790 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHKAP35790 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHKAP35790 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHKAP35790 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHKAP35790 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHKAP35790 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHKAP35790 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKAP35790 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKAP35790 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKAP35790 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKAP35790 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKAP35790 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKAP35790 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKAP35790 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKAP35790 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKAP35790 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKAP35790 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKAP35790 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKAP35790 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHKAP35790 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHKAP35790 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHKAP35790 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHKAP35790 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHKAP35790 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHKAP35790 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHKAP35790 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKAP35790 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKAP35790 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKAP35790 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKAP35790 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKAP35790 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKAP35790 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKAP35790 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKAP35790 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKAP35790 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKAP35790 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKAP35790 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHKAP35790 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHKAP35790 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHKAP35790 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHKAP35790 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHKAP35790 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHKAP35790 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHKAP35790 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKAP35790 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKAP35790 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKAP35790 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKAP35790 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKAP35790 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKAP35790 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKAP35790 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKAP35790 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKAP35790 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKAP35790 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKAP35790 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKAP35790 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKAP35790 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHKAP35790 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHKAP35790 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHKAP35790 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHKAP35790 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHKAP35790 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHKAP35790 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHKAP35790 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHKAP35790 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHKAP35790 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHKAP35790 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHKAP35790 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHKAP35790 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHKAP35790 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms