Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GTF2E1P29083 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF2E1P29083 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF2E1P29083 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms