Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLNP26678 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLNP26678 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLNP26678 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLNP26678 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLNP26678 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLNP26678 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLNP26678 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLNP26678 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PLNP26678 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLNP26678 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLNP26678 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLNP26678 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLNP26678 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLNP26678 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLNP26678 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLNP26678 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLNP26678 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLNP26678 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLNP26678 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLNP26678 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLNP26678 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLNP26678 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLNP26678 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLNP26678 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLNP26678 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLNP26678 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLNP26678 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLNP26678 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLNP26678 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLNP26678 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLNP26678 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLNP26678 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLNP26678 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLNP26678 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLNP26678 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLNP26678 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PLNP26678 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLNP26678 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLNP26678 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLNP26678 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLNP26678 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLNP26678 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLNP26678 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLNP26678 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLNP26678 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PLNP26678 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PLNP26678 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLNP26678 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLNP26678 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLNP26678 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLNP26678 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLNP26678 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLNP26678 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLNP26678 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLNP26678 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PLNP26678 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLNP26678 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLNP26678 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLNP26678 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLNP26678 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLNP26678 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLNP26678 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLNP26678 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLNP26678 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLNP26678 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLNP26678 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLNP26678 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PLNP26678 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLNP26678 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLNP26678 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLNP26678 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLNP26678 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLNP26678 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLNP26678 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLNP26678 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PLNP26678 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLNP26678 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLNP26678 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLNP26678 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PLNP26678 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PLNP26678 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLNP26678 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLNP26678 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms