Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRBP23467 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRBP23467 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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