Protein–RNA interactions for Protein: P21771

MRPS28, 37S ribosomal protein S28, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS28	P21771	MOT2	YER068W	1764 nt		5.09	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	IME2	YJL106W	1938 nt		5.08	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	SLC1	YDL052C	912 nt		5.08	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	MRPL36	YBR122C	534 nt		5.08	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	SRP101	YDR292C	1866 nt		5.08	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	PRI2	YKL045W	1587 nt		5.08	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	CDC19	YAL038W	1503 nt		5.07	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	ADE13	YLR359W	1449 nt		5.07	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	LHP1	YDL051W	828 nt		5.07	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	YEL067C	YEL067C	588 nt		5.07	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	MOG1	YJR074W	657 nt		5.07	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	PGA3	YML125C	939 nt		5.07	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	MET31	YPL038W	534 nt		5.07	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	MPS3	YJL019W	2049 nt		5.07	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	BLM10	YFL007W	6432 nt		5.07	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	GEP3	YOR205C	1671 nt		5.06	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	ATG20	YDL113C	1923 nt		5.06	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	PRE3	YJL001W	648 nt		5.06	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	ULA1	YPL003W	1389 nt		5.05	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	DDC1	YPL194W	1839 nt		5.05	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	LYS5	YGL154C	819 nt		5.05	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	PCT1	YGR202C	1275 nt		5.05	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	GRE1	YPL223C	507 nt		5.05	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	YPR160C-A	YPR160C-A	285 nt		5.05	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	MRPS5	YBR251W	924 nt		5.05	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	CLA4	YNL298W	2529 nt		5.05	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	SHE10	YGL228W	1734 nt		5.05	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	YPL260W	YPL260W	1656 nt		5.05	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	NUP116	YMR047C	3342 nt		5.05	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	NUD1	YOR373W	2556 nt		5.05	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	SEC9	YGR009C	1956 nt		5.04	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	SKS1	YPL026C	1509 nt		5.04	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	YDL023C	YDL023C	321 nt		5.04	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	ETT1	YOR051C	1239 nt		5.04	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	HSP82	YPL240C	2130 nt		5.04	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	VMS1	YDR049W	1899 nt		5.04	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	PRR1	YKL116C	1557 nt		5.04	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	BOP2	YLR267W	1713 nt		5.03	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	SPL2	YHR136C	447 nt		5.03	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	ETR1	YBR026C	1143 nt		5.03	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	RPL21B	YPL079W	483 nt		5.03	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	MRI1	YPR118W	1236 nt		5.03	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	ESF1	YDR365C	1887 nt		5.03	□□□□□ -1.6
MRPS28	P21771	PXA1	YPL147W	2613 nt		5.02	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	GCV3	YAL044C	513 nt		5.02	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	YMR245W	YMR245W	621 nt		5.02	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	MAP2	YBL091C	1266 nt		5.02	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	KAR2	YJL034W	2049 nt		5.02	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	VBA2	YBR293W	1425 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	TRS23	YDR246W	660 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	UTR4	YEL038W	684 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	ROX3	YBL093C	663 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	PRP28	YDR243C	1767 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	VID22	YLR373C	2706 nt		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	NOT3	YIL038C	2511 nt		5	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	LYS21	YDL131W	1323 nt		5	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	YHR045W	YHR045W	1683 nt		5	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	YDR417C	YDR417C	372 nt		5	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	MED6	YHR058C	888 nt		5	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	NME1	NME1	340 nt		5	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	GCN20	YFR009W	2259 nt		5	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	YPL245W	YPL245W	1365 nt		5	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	FAA3	YIL009W	2085 nt		5	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	ZUO1	YGR285C	1302 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	MSC7	YHR039C	1935 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	RPT1	YKL145W	1404 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	ORC5	YNL261W	1440 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	PPR1	YLR014C	2715 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	YCL065W	YCL065W	369 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	YRA1	YDR381W	681 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	SCS2	YER120W	735 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	DOT5	YIL010W	648 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	COX17	YLL009C	210 nt		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	GRC3	YLL035W	1899 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	UTP9	YHR196W	1728 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	STR2	YJR130C	1920 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	YIL067C	YIL067C	2037 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	ENV7	YPL236C	1095 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	RPO26	YPR187W	468 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	SKG3	YLR187W	3081 nt		4.98	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	ADE12	YNL220W	1302 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	GDB1	YPR184W	4611 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	TRX2	YGR209C	315 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	TIF2	YJL138C	1188 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	YJL215C	YJL215C	360 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	TIF1	YKR059W	1188 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	YGR266W	YGR266W	2106 nt		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS28	P21771	DOA1	YKL213C	2148 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS28	P21771	YKL023W	YKL023W	834 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS28	P21771	YIM1	YMR152W	1098 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS28	P21771	TRM44	YPL030W	1704 nt		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS28	P21771	YDR261C-D	YDR261C-D	4815 nt		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS28	P21771	RIM21	YNL294C	1602 nt		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS28	P21771	ARN2	YHL047C	1863 nt		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS28	P21771	PAN1	YIR006C	4443 nt		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS28	P21771	YGR016W	YGR016W	573 nt		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS28	P21771	KTI12	YKL110C	942 nt		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS28	P21771	TLG2	YOL018C	1194 nt		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS28	P21771	PMA1	YGL008C	2757 nt		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS28	P21771	OPT1	YJL212C	2400 nt		4.95	□□□□□ -1.62

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