Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB4P21439 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB4P21439 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB4P21439 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms