Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SDSP20132 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SDSP20132 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SDSP20132 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SDSP20132 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SDSP20132 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SDSP20132 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SDSP20132 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SDSP20132 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SDSP20132 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SDSP20132 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SDSP20132 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SDSP20132 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SDSP20132 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SDSP20132 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SDSP20132 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SDSP20132 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SDSP20132 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SDSP20132 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SDSP20132 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SDSP20132 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SDSP20132 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SDSP20132 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SDSP20132 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SDSP20132 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SDSP20132 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SDSP20132 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SDSP20132 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SDSP20132 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SDSP20132 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SDSP20132 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SDSP20132 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SDSP20132 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SDSP20132 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SDSP20132 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SDSP20132 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SDSP20132 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SDSP20132 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SDSP20132 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SDSP20132 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SDSP20132 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SDSP20132 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SDSP20132 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SDSP20132 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SDSP20132 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SDSP20132 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SDSP20132 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SDSP20132 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SDSP20132 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SDSP20132 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SDSP20132 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SDSP20132 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SDSP20132 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SDSP20132 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SDSP20132 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SDSP20132 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SDSP20132 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SDSP20132 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SDSP20132 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SDSP20132 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SDSP20132 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SDSP20132 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SDSP20132 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDSP20132 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDSP20132 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDSP20132 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDSP20132 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SDSP20132 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDSP20132 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDSP20132 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDSP20132 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDSP20132 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDSP20132 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDSP20132 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SDSP20132 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SDSP20132 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SDSP20132 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SDSP20132 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SDSP20132 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SDSP20132 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SDSP20132 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SDSP20132 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SDSP20132 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SDSP20132 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SDSP20132 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SDSP20132 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SDSP20132 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SDSP20132 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SDSP20132 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SDSP20132 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDSP20132 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDSP20132 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDSP20132 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDSP20132 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDSP20132 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDSP20132 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SDSP20132 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SDSP20132 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SDSP20132 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SDSP20132 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms