Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR2CP19387 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2CP19387 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2CP19387 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms