Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD58P19256 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD58P19256 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD58P19256 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CD58P19256 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD58P19256 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD58P19256 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD58P19256 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD58P19256 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CD58P19256 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD58P19256 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD58P19256 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD58P19256 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD58P19256 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD58P19256 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD58P19256 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD58P19256 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD58P19256 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD58P19256 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CD58P19256 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD58P19256 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD58P19256 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD58P19256 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CD58P19256 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD58P19256 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CD58P19256 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD58P19256 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD58P19256 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD58P19256 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CD58P19256 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD58P19256 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD58P19256 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD58P19256 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD58P19256 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD58P19256 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD58P19256 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD58P19256 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD58P19256 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD58P19256 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD58P19256 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD58P19256 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD58P19256 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD58P19256 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD58P19256 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD58P19256 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD58P19256 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD58P19256 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD58P19256 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD58P19256 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD58P19256 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD58P19256 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD58P19256 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD58P19256 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD58P19256 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD58P19256 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CD58P19256 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD58P19256 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD58P19256 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD58P19256 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD58P19256 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD58P19256 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD58P19256 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD58P19256 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD58P19256 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD58P19256 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD58P19256 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD58P19256 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD58P19256 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD58P19256 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD58P19256 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD58P19256 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CD58P19256 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD58P19256 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD58P19256 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD58P19256 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD58P19256 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD58P19256 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD58P19256 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD58P19256 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CD58P19256 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD58P19256 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD58P19256 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD58P19256 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD58P19256 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD58P19256 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD58P19256 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CD58P19256 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD58P19256 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD58P19256 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD58P19256 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD58P19256 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD58P19256 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD58P19256 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD58P19256 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD58P19256 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD58P19256 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD58P19256 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD58P19256 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD58P19256 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD58P19256 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms