Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAM1P18669 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms