Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF28P17035 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF28P17035 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF28P17035 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms