Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BMP3P12645 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
BMP3P12645 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BMP3P12645 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BMP3P12645 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BMP3P12645 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BMP3P12645 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BMP3P12645 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BMP3P12645 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BMP3P12645 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BMP3P12645 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BMP3P12645 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BMP3P12645 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BMP3P12645 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BMP3P12645 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BMP3P12645 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BMP3P12645 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BMP3P12645 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BMP3P12645 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BMP3P12645 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BMP3P12645 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BMP3P12645 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BMP3P12645 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BMP3P12645 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BMP3P12645 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BMP3P12645 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BMP3P12645 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BMP3P12645 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BMP3P12645 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BMP3P12645 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BMP3P12645 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BMP3P12645 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BMP3P12645 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BMP3P12645 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BMP3P12645 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BMP3P12645 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BMP3P12645 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BMP3P12645 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BMP3P12645 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BMP3P12645 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BMP3P12645 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BMP3P12645 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BMP3P12645 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BMP3P12645 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BMP3P12645 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BMP3P12645 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
BMP3P12645 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BMP3P12645 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BMP3P12645 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BMP3P12645 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BMP3P12645 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BMP3P12645 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BMP3P12645 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BMP3P12645 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BMP3P12645 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BMP3P12645 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BMP3P12645 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BMP3P12645 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BMP3P12645 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BMP3P12645 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BMP3P12645 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BMP3P12645 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BMP3P12645 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BMP3P12645 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BMP3P12645 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BMP3P12645 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BMP3P12645 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BMP3P12645 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BMP3P12645 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BMP3P12645 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BMP3P12645 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BMP3P12645 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BMP3P12645 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BMP3P12645 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BMP3P12645 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BMP3P12645 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BMP3P12645 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BMP3P12645 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BMP3P12645 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BMP3P12645 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BMP3P12645 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BMP3P12645 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BMP3P12645 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BMP3P12645 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BMP3P12645 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BMP3P12645 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BMP3P12645 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BMP3P12645 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BMP3P12645 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BMP3P12645 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BMP3P12645 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BMP3P12645 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BMP3P12645 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BMP3P12645 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BMP3P12645 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BMP3P12645 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BMP3P12645 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BMP3P12645 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BMP3P12645 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BMP3P12645 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms