Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFD1P11586 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD1P11586 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms