Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAA2P0DJI9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.3 ms